Cherry SNP DataBase

Gene information

Gene Pav_sc0001077.1_g360.1.mk
Chromosome name PAV_r1.0chr3
start 15659842
end 15673103
PAV_r1.0 name Pav_sc0001077.1
start 203360
end 216621
direction +
Annotation NR PREDICTED: cellulose synthase-like protein H1 isoform X1
Sequence CDS ATGTTTGTGGCAACAGCAGATGCAGAGCTAGAGCCACCCATCATCACAGTGAACACAGTG CTCTCTCTTCTTGCTGTAGATTATCCATCTCACAAGCTAGCTTGCTATGTTTCTGATTAT GGCTGTTCACCTCTCACCCTCTACTCTCTCACTGAAGCCTCTAAATTTGCTCAGTTTTGG GTACCCTTTTGCAAAAAGTATAATATTCAAGTTAGAGCTCCATTCAGATACTTCTCTGGC AATTCCAAATTGCCAAGTGATAATCCAATTGGGTTTCTACAAGAATGGACCAAAATGAAG GATGAGTATCAAAAGCTCTGCCAAAAAATTGAAGTTGCTGTCCAAAATTTGGCAACCCTT GATTTTTCTGGAGACTATGTGGATTTTGCTCACATAGACAGAAGAAACCATCCCACCATA ATCAAGGTAATATGGGAGAACAAAGAAAGGCTTTCTAATGAGCTGCCACAATTACTTTAT GTAGCCAGGGAGAAGCGTCCAAATCATTCACACCATTACAAAGCTGGCGCCATGAATGCT TTGACCAGGGTCTCTGGGGTGATGACAAATGCTCCATTTATGTTGAACGTCGACTGCGAT ATGTATGCCAACAATTCAAAGATCGTTCTTTATTCGATGTGCCTATTGCTTGGCTTCAAG CATGAAAAAGAAGGTGCATTTACAATTTGGCCGGGATTCGCTGGGATACAAGGACCTTTC TATGCAGGGACCGGATGTTTTCACAGACGTAAAGTTATCTATGGTTTATCCTTAGTAGAT AGTGAAGGAAATCTGACGGATGTGACACTGGATAAAGAAGAGTTGGGAAATTCCATGGAG TTCATCGAATCAGCAACTCATATTTTATCAGAGAAAATTGATCATCCTCGTGACCTTTCC ACTGCTGTTGTTGAGGCAGCCAACAAAGTTGCTGGTTCTGCGTACGAGTACAATACATTA TGGGGGACAAAGGTAGGCTGGCTTTATGGGTCAGTCACAGAAGATATCCTAACTGGGATG AAGATCCATGCAAGGGGCTGGAAGTCTATCTTATGCATGCCAGACCCACCAGGCTTTATC GGCTCTGCACCCTCATCTTCTCATATTGTGTTGACCCAAAGGAAGAGATGGGTCACAGGC CTCCTAGAAATTTTGTTCAGCAAAAATAGTCCCATCTTTGCTACCCTCTATGCTAAGTTG GAGTTTAGGCAGTGCTTGGCCTACACGAACGGGCTAATTTGGGGCCTAAATTCCATTCCT GATCTATGCTATACTATACTGCCAGCCTACTGTATCGTTACCAACTCACATTTCTTGCCC AAGCTATGGTGGAACCATGTGAGAATGGGGCCAGAGGGGAAAATACCCCGTTTAACTGCA TCGCTATTTGGAGTTGTAGCCGTGGTATTCAAGCTTTTGGGTATATCTGAGGTGGCATTT GAAGTCACACAAAAGGACCAAAATTCCTCTTCAAGTGATGACCAAGAAGATGATGCCAAT GCTGGTAGGTTCACCTTTGATGAGTCTCCAATATTTGTGCCGGCCACAACCCTCTTGTTT GTGCACTTCACAGCCCTGACCATGGGCTTGTTTGGGATGCAACCACCGGCTCGTGGTGCG GATGGGGCGGGGCTAGGTGAGATGATGTGCTGTGTTTGGGTGGATGAGTATCAAAAGCTC TGCCAAAAAATTGAAGATGCTGTCCAAAATTTGGCAACCCTTGATTTTTCTGGAGACTCT GGGGATTTTGCTGACATAGACAAAAGAAACCATCCCACTATAATCAAGGTAGTTTGGGAG AACAAAGAGAATAATGGGGTGCCACATTTAGTTTATGTAGCCAGGGAGAAGCGTTCAGAT CAATCACATCACCACAAGGCTGGCGCCATGAATGTTTTGACCAGGGTCTCTGGTGTGATG ACAAATGCTCCATTTATGTTGAACGTCGACTGCGATATGTATGCCAACAATTCAAAGATC GTTCTGTATGCGATGTGCCTATTGCTCGGCTTCAAGCATGAAAAAGAAGGTGCATTTGTT CAGTACCCACAAATGTTCTACGACACTTTGAAAGATGATCCATTTGGAAACCAACTGGTT CTCCCTCTAAAATTATCTTGGCCAGGGTTCGCTGGGATGCAAGGACCTCTCTATGCAGGG ACCGGATGTTTTCACAGACGTAAAGTTATCTACGGTTTTTCCTTTATGGATAGTGAAGGA AATCTGAGGGATGTGGCATTGGATCAAGAACGGTTTGGAAATTCCACGGAGTTAATCGAA TCAGCAACTCATACTTTATCAGAGAAAATTGATCATCCTCATGACCTTTCCAGTGCTGTT GAGGCAGCCAACAAAGTTGCTGGTTCTTCGTACGAGCACAATACATTGTGGGGCTGGCTT TATGGGTCAGTCACAGAAGATATCCTAACTGGGATGAAGATCCATGCAAGGGGCTGGAAG TCTATCTTATGCATGCCAGACCCACCAGGCTTTATCGGCTCTGCACCCTCATCTTCTCAT ATTGTGTTGACCCAAAGGAAGAGATGGGTCACAGGCCTCCTAGAAATTTTGTTCAGCAAA AATAGTCCCATCTTTGCTACCCTCTATGCTAAGTTGGAGTTTAGGCAGTGCTTGGCCTAC ACGACCGTCAAAGAACCGGCTCTCATAATCTTTGTTGCCGTGTTTCTAATGAAGATTTTG TACACCTTACGTTTTTACCTGGGATCTGGCCTATCAATCAATCAATGGTGGAACCATGTG AGAATGGGGCCATCGGGGAAAATACCCTATTTAACTACATCGTTATTTGGAGTTGTAACC GTGGTATTCAAGCTTTTGGGTATATCTGAGGTGGCATTTGAAGTCACACAAAAGGACCAA TATTCCTCTTCAAGTGATGACCAAGACGATGATGGCAACGCTGGTAGGTTCACTTTTGAT GAGTCTCCAATATTTGTGCCGGCCACAACCCTCTTGTTTGTGCACTTCACAGCCCTAGCC ATGGGCTTGTTTGGGATGCAACCACCGGCTCATGGTGCGGATGGGGCGGGGCTAGGTGAG ATGATGTGCTGTGTTTGGGTGGTGCTATGTTTTTGGCCATTTCTCAAAGGGTTGTTTGGG AAGGGCAAATATGGAATTCCAATGCCCACTATATTCAAATCAGCTGTCTTGGCCTTGCTT TTCATGCACTTCTGTGGAAGGATCCCTCTGCCACTGCGCCGCTGA
PEP MFVATADAELEPPIITVNTVLSLLAVDYPSHKLACYVSDYGCSPLTLYSLTEASKFAQFW VPFCKKYNIQVRAPFRYFSGNSKLPSDNPIGFLQEWTKMKDEYQKLCQKIEVAVQNLATL DFSGDYVDFAHIDRRNHPTIIKVIWENKERLSNELPQLLYVAREKRPNHSHHYKAGAMNA LTRVSGVMTNAPFMLNVDCDMYANNSKIVLYSMCLLLGFKHEKEGAFTIWPGFAGIQGPF YAGTGCFHRRKVIYGLSLVDSEGNLTDVTLDKEELGNSMEFIESATHILSEKIDHPRDLS TAVVEAANKVAGSAYEYNTLWGTKVGWLYGSVTEDILTGMKIHARGWKSILCMPDPPGFI GSAPSSSHIVLTQRKRWVTGLLEILFSKNSPIFATLYAKLEFRQCLAYTNGLIWGLNSIP DLCYTILPAYCIVTNSHFLPKLWWNHVRMGPEGKIPRLTASLFGVVAVVFKLLGISEVAF EVTQKDQNSSSSDDQEDDANAGRFTFDESPIFVPATTLLFVHFTALTMGLFGMQPPARGA DGAGLGEMMCCVWVDEYQKLCQKIEDAVQNLATLDFSGDSGDFADIDKRNHPTIIKVVWE NKENNGVPHLVYVAREKRSDQSHHHKAGAMNVLTRVSGVMTNAPFMLNVDCDMYANNSKI VLYAMCLLLGFKHEKEGAFVQYPQMFYDTLKDDPFGNQLVLPLKLSWPGFAGMQGPLYAG TGCFHRRKVIYGFSFMDSEGNLRDVALDQERFGNSTELIESATHTLSEKIDHPHDLSSAV EAANKVAGSSYEHNTLWGWLYGSVTEDILTGMKIHARGWKSILCMPDPPGFIGSAPSSSH IVLTQRKRWVTGLLEILFSKNSPIFATLYAKLEFRQCLAYTTVKEPALIIFVAVFLMKIL YTLRFYLGSGLSINQWWNHVRMGPSGKIPYLTTSLFGVVTVVFKLLGISEVAFEVTQKDQ YSSSSDDQDDDGNAGRFTFDESPIFVPATTLLFVHFTALAMGLFGMQPPAHGADGAGLGE MMCCVWVVLCFWPFLKGLFGKGKYGIPMPTIFKSAVLALLFMHFCGRIPLPLRR


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